Die Wasserchemie in Aquarien ist von entscheidender Bedeutung für die Gesundheit von Fischen und anderen Wasserlebewesen. 

Aquarien können mit Süß- oder Salzwasser betrieben werden. Salzwasser, entweder natürliches oder künstliches Meerwasser, wird in reinen Fischaquarien, reinen Fischaquarien mit Lebendgestein (FOWLR) und Riffaquarien verwendet, während Süßwasser in Pflanzen-, Biotop-, Buntbarsch-, Brackwasser- und Raubfischaquarien eingesetzt wird. Erstere sind im Allgemeinen teurer und schwieriger zu pflegen, da zusätzliche Ausrüstung und häufige Tests erforderlich sind. 

Um eine gute Wasserqualität zu gewährleisten, ist eine regelmäßige Wartung (Filterung, Wasserwechsel und Tests) erforderlich.